Святитель Феофан Затворник — один из самых почитаемых русских святых XIX века. После смерти в 1894 году он был погребён в Вышенской обители, где провёл 22 года в затворе. Над могилой установили мраморное надгробие с изображением трёх его основных трудов: «Добротолюбие», «Толкование Апостольских посланий» и «Начертание христианского нравоучения».
В 1920-е годы монастырь был закрыт, храмы осквернены, но мощи святителя оставались в разрушенном Казанском соборе. Осенью 1972 года игумен Марк (Лозинский), иеромонах Георгий (Тертышников) и Евгений Диденко тайно извлекли мощи из склепа, очистили, собрали все кости и вывезли их в Троице-Сергиеву лавру. Там по благословению архимандрита Кирилла (Павлова) мощи были скрыты под Успенским собором и замурованы в стене.
В 1988 году, накануне общецерковного прославления святителя, мощи перенесли в храм преп. Сергия Радонежского в селе Эммануиловка, где они пребывали 14 лет. После восстановления Вышенской пустыни в 1990-х годах, 29 июня 2002 года мощи были возвращены в монастырь. А 14 марта 2009 года, после освящения Казанского собора, они были перенесены на своё историческое место погребения.
